江湖上闻名例不虚发的“小李飞刀”终于被制服在美而慧的银姬的爱情情调中，从此过著归隐山林，伴著银姬共享幸福，过著最甜蜜、最美满的生活。江湖是最无情的，只要你一旦涉足其间，就永远也无法脱身，除非是命丧黄泉。“小李飞刀”虽然决心远离江湖，偏偏就有人说什么也不放过他，想尽办法要达到逼使小李飞刀重入江湖的目的！他是谁呢？小李飞刀的仇家吗？一个黄昏，像平时一样祥和宁静的黄昏，银姬又像每天一样藉著喂狗，早就在院中等待著心爱的丈夫从田地里回来；果然，脚步声传来了，她正准备飞奔过去时，一柄利刃突然穿胸而过！银姬死了，小李飞刀的美梦也粉碎了，而且碎得那么彻底，他终于明白：一旦涉足江湖，就永远无法脱身了！但是，银姬是无辜的，她不该落到这样的下场。因此，小李飞刀思考著，他决不能原谅这个凶手，他要报复，他要以更残酷的手段对付这个凶手！(银姬手上抓著撕下凶手的衣角，小李飞刀已认出是黄金帮所为) (拜别了银姬的坟前)“小李飞刀”终于重出江湖了，但是他不再是以往那个温文有礼、仗义而行的“小李飞刀”，他变成一个杀手，一个以杀人为职业的职业凶手。(小李在黄金帮的东坛分舵找到了杀死银姬的凶手，并以飞刀将之击毙 近十年来，崛起江湖的一股新势力黄金帮，在帮主司徒黄金领导下，势力迅速扩充。天下第一流好手，也有泰半的人物慑于黄金帮的权势，或是想利用黄金帮来巩固自己，纷纷投效黄金帮，于是更加强了司徒黄金称霸武林的欲望，他曾经再三礼聘小李飞刀，偏偏“小李飞刀”因已获美眷归隐山林，不肯接受司徒黄金的邀聘，乃使黄金怀很在心，必欲得之而心安，乃与“天下第一美人”李梦仙勾结，以“小李飞刀”唯一挚友阿健为饵，诱小李飞刀现身，阿健与小李情逾手足，以出手快捷闻名江湖，与“小李飞刀”堪称一时瑜亮，无奈英雄气短、儿女情长，痴迷于“天下第一美人”李梦仙的美色，“小李飞刀”虽然一再劝诫，始终无法自拔。(小李得知李梦仙是个人尽可夫之人，为报复小李而迷乱阿健、勾结黄金帮少帮主司徒燕飞…，当欲劝离阿健时，阿健已不知所踪) “小李飞刀”在连续杀死黄金帮几位分舵主后，司徒黄金勃然大怒，这时“百毒门”护法岳龙吟前来求见，欲以“小李飞刀”的性命交换帮主的保护，这其中自然有蹊跷。司徒黄金应允与岳龙吟结拜为金兰兄弟，并备宴天下群雄。 结拜大典隆重举行，处身秘密岛上的黄金帮总部(黄金堡垒)，一向不轻易接纳友朋，此次大举开放，江湖中人莫不希望一探秘密宝地，纷纷应邀而来。黄金帮总部果然不同凡响，不但气派宏伟，而且礼数周到，众人大喜。但是，奇怪的事情接二连三地发生了，赴宴的江湖好汉一个个神秘失踪……，一场惊天动地的武林血战就此拉开序幕！ 到底岳龙吟有没有达成结交司徒黄金的目的？ 而司徒黄金究竟暗藏著什么阴谋？ “小李飞刀”究竟有没有找到害死银姬的凶手？
北宋晚期，朝廷内忧外困，武林动荡，夜叉门趁机作乱。京都聚义钱庄遭人洗劫，掌柜钱无用在密室中被杀人焚尸，凶手疑于少林有关。少林顽逆弟子李少白奉命助官府办案，却与开封总捕狄八方不和，冲突不断。 另一方面又有人接连遇害。李少白察觉凶手的本意并非谋财，而真凶仍在钱庄之中。
因身怀“鸳鸯双刀”绝技而驰名江湖的白衣少侠雷力（姜大卫）被龙异之（谷峰）设计陷害，自废右臂退出江湖后，他隐姓埋名于某个小饭馆里当伙计，过着任人侮辱欺负的日子。邻居铁匠的女儿巴蕉（李菁）因对他心生爱慕，时常鼓励其重塑形象，无奈雷力战胜不了心魔。 有缘结识翩翩少侠封俊杰（狄龙）后，雷力重拾生活的信心，并说好在封俊杰赴过龙异之的约后两人一起去过归隐的生活。不幸的是封俊杰像多年前的雷力一样也中了龙异之的诡计，奋力抵抗一番终因不敌敌手身亡，得知消息的雷力大悲，矢志用左臂练就一身好功夫为好兄弟报仇。
故事讲述石中坚（郭振峰 饰）自幼随养母梅芳姑于深山居住，一日偶拾「玄铁令」，并得谢烟客传授武功，却被长乐帮帮众误认为帮主石中玉；及后更被丁珰所骗，愿意替石中玉到雪山派代罪领死。最后真相大白，石中坚竟为石清失散多年的儿子。
影片由一系列失踪、杀人、强奸、绑架等案件引出故事，作为警察的李楠一直头疼侦破线索无法找到。直到多人被绑架后，和李楠关系最亲密的王医生在绑架现场发现了一种致幻药物，关键时刻唤醒了次人格分裂的李楠，从而牵连出一场隐埋了三十年之久的仇恨大阴谋。三十年前，李楠亲生母亲美芬和亲生父亲郝爱国私通奸情生下了自己，然而郝爱国因为要与自己不爱但有家势的女人结婚，怕美芬影响自己的仕途而准备将其送出偷渡。没想到随后美芬被两渔民强奸，一时绝望的美芬跳海自杀，留下小李楠被神秘黑衣人偷抱回家抚养长大。黑衣人本与美芬青梅竹马，但被郝爱国陷害毁容，并趁机夺走占有了美芬。仇恨的种子使得黑衣人怀恨于内心深处，无意间发现美芬被渔民强奸时也咬牙狠心没管，抱走小李楠抚养后，从小让其服用一种致幻的药物，导致李楠长期不自觉的出现幻视幻听幻觉，甚至开始人格分裂。三十年后，在黑衣人潜藏的仇恨和阴谋下，一场连环绑架犯罪拉开序幕......
唐山（甄子丹 饰）留洋学得医术后归国，与助手刘国邦在上海闸北的贫民区开设西医诊所。当地斧头帮恶霸于老七（于荣光 饰）为了得到一块地皮，经常带人殴打村民，唐山与刘国邦出手制止行凶，又义务诊治受伤村民。为制止于老七，唐山拜访了那块地的主人——自己在英国时的老师西蒙，以为西蒙工作为代价，唐山保住了村民的土地。于老七的妹妹于小倩（朱茵 饰）多年来患有喉疾，不能说话，笃信狐仙的于老七以为求仙可令妹妹痊愈，排斥西医治疗，小倩机缘巧合结识唐山，后者的诚意打动了小倩，令其接受了手术。与此同时，贫民窟中的孩子们陆续失踪，唐山发现此事的幕后主使是斧头帮和西蒙，一场恶战在所难免。
民国初年，北方盘龙镇来了一神秘男子巡城马。抢山贼银票的姚氏藏于巡城马投宿的房中被山贼误为一伙，追杀中，由胡某救下，为报恩须十二天内安然将四个木箱送至给匪头焦龙原来胡已捉去姚家人，巡城马见日落姚未归，前去搭救，才知道他们送去的是屠杀革命党人的……
年羹尧奉师父顾肯堂之命，往云家堡送信，邀约云家共助四皇子夺取王位。不料在路上遭到秦岭派伏击，丢失了信件，被云家关押。与他有婚约在先的云中凤伺机搭救。正在此时，四皇子亲临云家堡……
清末，同盟会在各地秘密发展会员，许多武林英豪都加入了，清廷也暗里派出杀手到处侦缉革命党人。在洪家集，来了一个自称是浪迹江湖的林杰。武林前辈洪盛看他是个豪杰就收留了他。在洪盛为武昌起义押送筹集资金的路上被人杀害，小翠开始怀疑林杰，并认出他是杀害自己父母的凶手。后来大家合力刺死了林杰，原来他就是朝廷派来的钦命大侠和蒙面人，小翠看到父亲与表哥惨遭杀害，痛不欲生。这时，洪家集乡民与清兵展开激战，美霞与小翠也投入到反清抗暴的斗争行列。
玲珑山庄主十三燕早已退出江湖，李少白和狄八方却在其房里发现命案物证，然而十三燕中毒多年已成废人，少白查出十三燕好友屈方才是真凶。屈方听令于夜叉组织，下毒抢劫继而栽赃十三燕。
开封城内，许多孩子神秘失踪，案情与大兴赌坊有关。李少白到赌坊调查，发现赌坊老板韩天佑独子韩星儿也被人掳走。韩天佑是名震江湖的千佛手，而他最大的敌人就是二十年前败在自己手下的赌王玉面罗刹诸葛卿……
