冢本天满（小清水亚美 配音）是一名个性迷糊的高中生，她的性格向上生活也充满了欢乐。只是，单纯的天满心里有一个名叫乌丸大路（小西辽生 配音）的暗恋对象，这让乐观的她偶尔的有些苦恼。乌丸大路顶着西瓜头，成绩优秀运动万能，可是看似完美的他却有着怪异的行为和只属于自己的秘密，身患绝症的他即将不久于人世。外表狂野个性粗暴的播磨拳儿（高桥广树 配音）内心有着柔软天真的一面，这一面的名字叫做天满，可是天然呆的天满似乎从未注意到过他的感情。当他鼓起勇气对天满表白时候，出现在眼前的女子，却是个性直爽的学院偶像泽近爱理（堀江由衣 配音）。面对播磨火辣的表白，泽近爱理的心里产生了异样的感情。
　　在矢神高中里，迷糊而快乐的校园生活每日都在上演。

　　一天雨夜，青年漫画家西（今田耕司 配音）在地铁站出来遇见了初恋梦中情人弥（前田沙耶香 配音）。西送弥回家途中得知了弥已订婚，随后，他被弥邀请到酒馆喝酒，弥的未婚夫也来了，西虽然嫉妒弥的未婚夫，但自愧不如。这时，黑社会来到店里，原来弥被黑社会所追杀，打晕了弥的男友并要强奸弥，西则蜷缩一旁不敢动弹。黑社会发现了一旁的西，用枪爆了他的屁眼。前一刻，西还沉醉于与初恋梦中情人相逢时的甜蜜，下一刻就肛门中枪，贯穿脑部，死于非命。当西等人上了天堂，西觉得自己死得很难看，后悔人生过得很窝囊，决心再度复活。他们一行人违反神的意旨，并回到地上的世界，却阴差阳错却来到了鲸鱼的肚子里，接下来又将会有什么等待着他们呢……

　　蓬莱岛，相传为古时候的神之岛，秦始皇曾派徐福及三千童男童女寻找蓬莱，以觅长生不老之方。岛上生活着人类、妖怪和半妖，他们和睦相处，自由自在。为了防止半妖受到伤害，巫女奏使用法术使蓬莱岛隐藏起来，每隔50年才会伴着浓雾出现一次。然而邪恶的四斗神趁小岛结界虚弱之际潜入，污染鸣动之窑，对岛上居民进行无情统治和屠杀。在戈薇到达战国时代的50年前，犬夜叉曾和桔梗乘船登上蓬莱，结果遭遇四斗神。在交战中，犬夜叉的力量被四斗神封印。
　　50年后，蓬莱岛再次出现。半妖阿蓝趁机逃出，遭到四斗神一路追杀，最后幸被犬夜叉一行救下。为了拯救岛上居民，犬夜叉、戈薇等人决定踏入蓬莱。另一方面，阿蓝的姐姐浅葱决定跳入窑中保全兄弟姐妹们的性命……

　　面包是一款老少皆宜的美食，在某些国家，人们甚至将面包作为每日的主食。在这世上，有英式面包，有法式长棍，有德式全麦，但却偏偏没有所谓的日式面包，对于身为纯正日本人的少年东和马（小林由美子 配音）来说，这不能不算是一种遗憾。因此，从小就对面包有着深厚感情的东和马决定走上面包的修罗之路，发誓要制作出能够代表日本的面包，让日式面包称霸全球。
　　东和马的秘密武器是一双比常人温度略高的手掌，人称“太阳之手”，经过这双手揉制发酵的面团总是能够为食客带来惊喜。在修炼的途中，东和马结识了热血青年河内恭介（阪口周平 配音）和面包店老板的女儿梓川月乃（大冢千寻 配音）。在三人的努力之下，他们在世界范围内的各大面包大赛中崭露头角，逐渐的朝向梦想的终点前进着。

　　泽村正治（谷山纪章 配音）是一个十足的冷硬派男子，个性好强的他在校园中少不了打架惹事，同学们给个性粗暴的他取了“狂犬”的外号。其实，正治的内心中对于女性的温柔十分的渴求，可惜接连的告白失败打击了他的自信，让他逐渐关闭起了心门。
　　某一日，正治发现曾经打架得力的右手居然变成了一个活灵活现的女孩！女孩名叫春日野美鸟（中原麻衣 配音），对于自己莫名其妙变为正治右手的原因也并不十分了解。就这样，正治和美鸟两人开始了他们的同居生活。美鸟的温柔体贴化解了正治内心的坚冰，由于失去右手无法再打架，正治也闹出了不少的笑话。正治的改变全部都被绫濑贵子（高木礼子 配音）看在了眼里，曾经十分反感正治的她竟然慢慢的被正治吸引。徘徊在两个女孩子之间，正治究竟应该何去何从呢？

　　凪宗一郎（保志总一朗 配音）和卜比牧原（三木真一郎 配音）的到来让本来平静的统道学园鸡犬不宁。虽然统道学园是一所武校，但学校提倡平和理智的武道，反对无因的暴力，而宗一郎和牧原两人此次的目的却是征服这座学校。结果可想而知，宗一郎被前来的柔剑部部长枣真夜（久川绫 配音）及高柳雅孝（关智一 配音）一脚踢飞，倒霉的他掉入了刚洗完澡的枣亚夜（茅原实里 配音）身上，没想到枣亚夜对他一见钟情。于是，有着女性恐惧症的宗一郎在统道学园的快乐生活开始了。                                    
                               　　而随着校园生活的推进，一些被称为“柱”的标志逐渐浮出水面，这些标志分别刻在谁的上？又代表了什么？宗一郎决定一探究竟。

　　佐佐木雪成（能登麻美子 配音）因为他女性化的外表和柔弱的个性常常遭到班上女生们的欺负，导致他患上了女生恐惧症，一旦有女生接触他，他的身上便会长出荨麻疹。一天，雪成回到家中，打开浴室的门，里面竟然站着他的邻居桐绘（斋藤千和 配音），两人在拉扯之间，桐绘将雪成推到了浴缸中，哪知道雪成就此穿越到了异世界中。
　　在这个世界里，男性属于非常稀缺的资源，因此格外受到女性青睐，与此同时，雪成对这个世界的女性并不会发生过敏反应。活泼开朗对一切都充满了好奇心的米哈露（川澄绫子 配音）、患有男性恐惧症的可悠蜜（仓田雅世 配音）、娇小可爱的朵茉卡（斋藤彩夏 配音），这些女性都向雪成展开了行动。

　　在未来的某一天，一对男女Retro（山口胜平 配音）和Pandy（本田贵子 配音）在一片荒野中醒来，却发现自己不但赤身裸体而且丧失了记忆。二人来到了东京闹市中肆意抢劫衣服和食物，经过一番大战后，两人被捕，并被投放到月球上的监狱“Dead Leaves”。
　　经过一段短暂的禁闭生活后，他们发现这座监狱是一所克隆工厂。两个看守员随意杀害克隆人，于是Retro和Pandy萌生了越狱的念头。Retro和Pandy轻而易举地解开了身上的锁，更不可思议的是，他们居然对这座监狱了如指掌。他们的真实身份究竟是什么？

　　影院正在上映奇侠电影《风云公主大冒险》，鸣人（竹内顺子 配音）情不自禁大声喧哗，结果连同波佐助（杉山纪彰 配音）、小樱（中村千绘 配音）一同被赶出电影院。正当鸣人望着电影海报发呆时，竟发现风云公主骑着快马从身边呼啸而过，其身后另有数名骑马的追兵。三人未作迟疑，起身相助。结果从卡卡西口中得知，追兵的头目竟是此次任务的委托人，逃跑的风云公主则是影片的女主角富士风雪绘。原来《风云公主大冒险》的结局将在雪之国，可当雪绘听说这个名字后经落荒而逃，卡卡西他们的任务正是担当雪绘的护卫。似乎，在雪绘和雪之国之间，隐藏着不为人知的秘密……
　　本片为《火影忍者》第一部剧场版动画。