故事发生在一颗名为可伦星的美丽星球上，邪恶的欧帝于无意之中得到了拥有强大法力的魔豆，别小看这小小的一颗豆子，它却能够激发出人们心底潜藏的欲望，制造出无限的麻烦。类似的豆子共有七颗，野心勃勃的欧帝打算将它们全部掌握在手中，以此称霸世界。
　　熊猫果王潘欧识破了欧帝的阴谋，它派出了女儿可可来到可伦星，去那里寻找一位“救世主”。皮皮（谢洁贞 配音）是一只个性有些胆小的熊猫，连它自己也没有想到的是，自己竟然就是这位救世主，然而，皮皮并不想去拯救什么世界，也不想成为英雄，它只想能够进入电视台工作，待在心爱的拉拉身边。

　　知名舞台剧女演员牧树里这日收到怪盗基德的预告信：在26个字母的盘旋飞舞中，他来拜领无价的“命运的宝石”。毛利小五郎受到牧树里委托将信件分析，认为基德将在演出最后一晚前来盗取宝石，当晚他及柯南、小兰等人来到剧场，那里早有诸多警察守候。
　　令柯南吃惊的是，基德竟扮成工藤新一出现在众人面前，但他及众人方向不同的紧张过后，宝石并没被盗，柯南醒悟字母预告信与航班相关。而柯南、小兰、牧树里及其同事搭乘的前往北海道的飞机上，尚有一起杀人计划正被精心设计。

　　泽村正治（谷山纪章 配音）是一个十足的冷硬派男子，个性好强的他在校园中少不了打架惹事，同学们给个性粗暴的他取了“狂犬”的外号。其实，正治的内心中对于女性的温柔十分的渴求，可惜接连的告白失败打击了他的自信，让他逐渐关闭起了心门。
　　某一日，正治发现曾经打架得力的右手居然变成了一个活灵活现的女孩！女孩名叫春日野美鸟（中原麻衣 配音），对于自己莫名其妙变为正治右手的原因也并不十分了解。就这样，正治和美鸟两人开始了他们的同居生活。美鸟的温柔体贴化解了正治内心的坚冰，由于失去右手无法再打架，正治也闹出了不少的笑话。正治的改变全部都被绫濑贵子（高木礼子 配音）看在了眼里，曾经十分反感正治的她竟然慢慢的被正治吸引。徘徊在两个女孩子之间，正治究竟应该何去何从呢？

　　16岁的少年三栗智和在某个夜晚做了个奇怪的梦。在这个未曾见过的梦世界里，看到一个少女在和敌人战斗。在那个梦世界智和有着不可思议的力量，并给予少女那个力量来击退敌人。智和就在这种迷惑下醒来，并且感到吃惊的是，醒来后发现梦中出现的少女就出现在自己旁边。除了神秘的美少女“莫奈”以及生活在一起的堂姐妹千条七濑与千条九叶，还有就是从小青梅竹马的水月，现实在梦世界的战斗现在从这里开始！

　　在一列从东京开往大阪的特快列车上，坐着一位尊贵而特殊的客人。她是来自欧洲英格拉姆帝国女王莎莉贝丝，随行的还有其年幼的儿子菲利浦王子。女王拥有一颗欧洲最大的宝石——水晶之母，这也引起了怪盗基德的注意。为了防止基德得手，女王身边布置大批保镖和警力。中森警官是日本警方的总代表，而他的女儿青子以及基德的真身快斗也同在这列火车之上。
　　眼看离预定时间越来越近，快斗却始终没有找到宝石真正的藏匿地点。与此同时，国际宝石大盗杰卡尔和罗丝也尾随前来，他们企图在基德得手之际趁火打劫。同在火车上的柯南从伪装成乘务员的罗丝身上看出蹊跷。一场宝石的攻防战随即展开……

高町奈叶（田村由香里配音）是一位平凡的高中三年级学生，某日，在上学的路上，她同来自异世界米德其路达的尤诺（水桥香织配音）相遇了。尤诺告诉奈叶，她正在寻找遗落人间的太古遗产“圣石之种”，这种珍贵的宝物蕴藏着巨大的能量，如果弃之不顾有可能在人间界造成巨大的破坏，接二连三的波折之后，奈叶成为了帮助尤诺回收种子的魔法少女，开始了一段充满了危险和刺激的奇幻旅程。某日，一位名叫菲特（水树奈奈配音）的金发少女出现在了奈叶的面前，她和奈叶一样同为回收种子的魔法少女，也就是说，她们的关系是竞争者。奈叶能够打败这样一位强劲的对手吗？对于菲特来说，温柔而又努力的奈叶又是一种怎样的存在呢？

　　2004年9月30日から2005年9月29日までテレビ東京系で毎週木曜夕方6時30分から放映。全52話。テレビ東京で東映アニメーションの作品が放送されるのは『キン肉マン二世』以来であり、放送時間が異なるが、『エア・ギア』、『出ましたっ!パワパフガールズZ』等、東映アニメーションの作品が本作の放送が始まった2004年から2007年6月末まで続いた。それ以降は一時期途切れる事になるが、2008年4月放送開始の『うちの3姉妹』で再び東映アニメーションの作品がテレビ東京で放送されることになる。原作の黒の地平編終了（グリニデの死）までのエピソードをベースに、若干のアレンジやオリジナルエピソードを加えて構成されている。 テレビ東京開局40周年記念作品。
　　2005年10月6日から第2シリーズ『冒険王ビィト エクセリオン』に改名し、2006年3月30日まで全25話を放映。 全編アニメオリジナルのストーリーが展開された。スタッフ等に大きな変更はなし。
　　ナレーションは田中秀幸。