第二部里，张大勇（陶大宇饰）与李忠义这对默契排档继续与狡猾凶狠的罪犯斗智斗勇。感情方面，大勇与高婕（郭可盈饰）成为斗嘴情侣，感情稳定增长。新来的女警员蓝嘉文（郭霭明饰）单纯善良，暗恋大勇并主动示爱。令大勇和高婕的问题出现新的危机。此时，高婕发现嘉文过去曾在外国因为三角恋而放火杀人，正当要揭发这一段过去时，高婕的朋友离奇被杀。嘉文对过去的矢口否认也不像假装，大勇与高婕的误会加剧，事情的真相扑朔迷离。

　　戴东官（欧阳震华 饰）经营着又父亲用毕生精力创建的酒楼，自称拥有“皇帝舌”的戴东官尝尽了天下的美食，用心打理酒楼的生意。一天他遇到了一个声称要为父报仇的小小（陈妙瑛 饰），小小竟然出卖东官使东官不得不逃到了北京。不久小小得知东官是无辜后，主动前往认错，两人冰释前嫌。
　　东官有一好友勉良（郭晋安 饰）为了考取功名而日夜苦读，幸好有翠花（梁艺龄 饰）周到照顾，当他与翠花成婚后也成功高中，但没想到勉良竟与昔日爱人倩容（张慧仪 饰）旧情复燃，翠花忍气吞声顾全丈夫声明，却被倩容的贪念毁了勉良的前途。
　　另一方面，东官成为了宫廷的御厨，但却受到了小小师兄的陷害。此时东官的红颜知己心茹（陈松伶 饰）怀有了皇帝（江华 饰）的孩子，害怕太后不愿接受，皇帝逼东官迎娶心茹。早已与小小结成伉俪的东官，面对爱吃醋的老婆小小，不止如何是好。不知情的小小甚至要告至公堂。

　　三堂主上官一剑把大堂主赵翎的首级献给徐门，以示投降。赵翎之子赵轩(姜大卫)潜入徐家堡，为父报仇，欲杀上官一剑之际，捏碎了「琥珀青龙」，内藏其父之遗书，始知其父原是甘愿献出头颅让上官一剑伪降徐家堡，藉以进行反间计。真相大白，赵轩遵父命，与上官化解仇恨，誓要合力消灭徐家堡。

　　女警姚自如（王敏奕饰）对周遭的声音、光影，甚至他人的情绪感受都特别敏感，凭此天赋解开凶案的迷思。如私下一脸“高冷”，甚少与人建立紧密关系，在旁人眼中，她是城市里的“旁观者”。“兔子洞”店长王觅希（周柏豪饰）希望每位食客能暂时抛开生活压力，放松心情享受“小确幸”。希的脸上永远挂着一抹微笑，他喜欢听客人的故事，却从不分享自己的故事。如查案时往往把情绪和感受投放进去，每当如与希闲聊后，有结未解的情绪便得以舒缓，久而久之两人愈见投契。
　　此时出现了两宗凶杀案，受害者生前都是曾间接令亲人死亡的“旁观者”。如觉得凶手是同一人，决意要将连环凶手拘捕。然而，调查愈深，如便愈能感受凶手的内心，甚至拉近与“他”的关系，使她陷入矛盾中⋯⋯如能否抑压内心情绪，亲手拘捕真凶？

　　中法战争初期，黑旗军刘永福领兵屡败法军，而此时清廷的苟安政策推行，荣禄不惜丧权辱国，力主停战,但不为刘接受，副将王守忠（何家劲饰）更屡战屡胜。荣禄爪牙利诱忠不遂，设计逼害,从而引起一连串的绝境逃亡,武林中的冷血斗争、以及爱与恨的矛盾……

　　D.I.E.被迫解散，原组员都重返原先的工作岗位，这班人不改之前古灵精怪的作风，令领导很是头疼，为了躲开这批难缠的下属，子朗（郭晋安 饰）顶头上司罗有恒（郭峰 饰）主动提出重组D.I.E. 但由于D.I.E.原主管费SIR已退休，罗有恒被迫接管。晶晶（郭羡妮 饰）在结束 产假后也迅速回到了D.I.E.。子朗和晶晶无处安置孩子，只得带着他上警局，一连串扣人心弦的案件接连上演。另一头，正义（郭政鸿 饰）和子晴（曾华倩 饰）则恋情告急。众人还渐渐发现，子朗的孩子竟也遗传其父的异能，晶晶也因此屡屡破案。谁知竟然再次惹祸上身，子朗、晶晶一家三口是否能顺利脱险？正义和子晴是否真的缘尽？

　　一九四九年的上海正是多事之秋，靳康年(邓浩光)与董敏(翁虹)邂逅而坠入爱河，但几经波折才再度重逢，誓言决不分离。可惜康不久被对他有心病的靳子轩(陈锦鸿)迫害，被屈入狱。当康获释时，康、敏仿似隔世重逢。一次难得机会，敏可到美国深造音乐，康为了不想拖累敏，嘱敏先往美国等之，而自己却赴外地从军。不久敏获悉事实，便回国找康，惜不果。数年后，康突然出现，并被卷入文化大革命浪潮中，遂掀起一场激烈的恩怨情仇。

　　督察袁金昌（欧阳震华 饰）和电视女主播杨夕雪（关咏荷 饰）相恋多年，在一次办案中，袁金昌误杀恋人夕雪，无限悔恨的他灵魂出窍，穿越时空，现身于宋朝，摇身一变成了包青天。他运用现代知识，与开封六子屡破奇案。不久，他遇到一个叫韩霜霜的女子，惊讶地发现她与夕雪长得一模一样。可惜霜霜生性冷傲，且遗忘了前世所有记忆。不过，二人在查案过程中渐渐互生情愫。然而这一世注定悲剧收尾，霜霜再次死于他手中。苦痛中他再次穿越时空，来到了50年代的香港，再次遇到了与夕雪长得一样的女子，二人命运再度缠绕，这一世，是缘分还是劫数……
　　三段时空，三世情缘。宿命能否逆转，有情人能否终成眷属？

　　殷然（蔡思贝 饰）生长在一个和睦的家庭之中，为人正直善良，颇受朋友和长辈们的喜爱，然而，某日，厄运毫无征兆的降临到了她的头上，殷然的父母在一场事故中双双去世，保险公司拒绝赔偿，事故的起因亦颇为蹊跷。毕业后，殷然放弃了救死扶伤的医生志愿，转而成为了一名保险公司调查员，只为了有朝一日能找出事件的真相抚慰父母的在天之灵。
　　某日，殷然遇见了名为乔文杰（吴启华 饰）的陌生男子，乔文杰和管家张克莱（周骢 饰）过着离群索居的生活，身世过去都是谜团，这样的男子却和殷然组成了搭档，共同调查保险赔偿意外。乔文杰有着一段不为人知的悲伤往事，而凌若菲（李诗韵 饰）的出现让这段往事再度浮出水面。

　　查向善（江美仪 饰）是一名全职母亲，看着两个可爱的女儿渐渐长大，对她们从生活到学习都严加管教，生怕一点疏忽造成不可挽回之错。无奈大女儿严茜瑜（江嘉敏 饰）并不明白母亲的一片苦心，压抑之中和母亲的关系十分紧张，父亲严夏（黄智贤 饰）又遭遇中年危机，最终夫妻两人感情破裂，虽然仍然住在同一屋檐下，却有名无实。
　　那边厢，查向善和家教会的另一名母亲袁圆（吕慧仪 饰）之间亦保持着针锋相对的关系，互相视对方为眼中钉肉中刺，所幸得到训导主任文嘉熙（陈敏之 饰）从中调解，方才化干戈为玉帛。然而，查向善发现严茜瑜竟然和文嘉熙的弟弟文亮熙（何广沛 饰）情投意合，她暗中和文嘉熙联手，希望拆散这对鸳鸯。

　　李奇（罗嘉良 饰）因为不愿同警长雷劲（骆应钧 饰）同流合污而遭到了后者的排挤和刁难，然而李奇机敏聪慧，屡屡凭借自己的力量破获奇案，雷劲因此也奈何不了他。罗帮办是一手教导李奇成才的师傅，他告诉李奇，如果能够破解二十年前的女飞贼黑玫瑰之悬案，或许就能够彻底扳倒雷劲，李奇摩拳擦掌，斗志昂扬。
　　为了调查案件，李奇来到了丽池夜总会，却在这里偶然撞见了遇到了麻烦的旧日好友谢四（林家栋 饰），不仅被卷入了黑道的纷争之中，还失去了唯一的住所。于是，李奇住进了谢四的叔叔家中，由此结识了美丽善良的程宝珠（张可颐 饰）。李奇并不知道的是，他一心想要追捕的黑玫瑰，其实就潜伏在他的身边。

　　飞鸿自小丧母，跟随父亲黄麒英四处流浪，在街头卖艺卖药为生。飞鸿生性聪明，冲动好胜，爱抱打不平，又自恃武功了得，常以武力替人出头。麒英虽然也富正义感，亦是一代宗师，唯不主张儿子凡事以武力解决，只希望儿子可以用心习医，继承自己衣砵做个出色的跌打医师。孝顺的飞鸿亦尽量听从父亲，在父亲面前尽量装作乖乖仔，事事都由父亲出头，因知道麒英不认同甚么集各家之大成，于是瞒着父亲偷偷研习各家各派武功，但只要父亲不在，其不平则鸣之性格便会毫无隐藏地表露无遗。
　　二人自飞鸿母亲离世后，便因为不受亡母外家欢迎而离开佛山。这次适逢流浪到广州，飞鸿又很想回乡，麒英便答应返佛山一行。二人回到佛山，始知飞鸿外祖父母已经移居花旗国，只有亡母的妹妹宝姨一人因为逃婚、没多久前才回到佛山，还打算经营一家西茶馆。宝父母家境不错，只觉当日女儿委身下嫁一个武夫，最后更病故，故对麒英有所埋怨。宝曾于国外居住，思想洋化，与有点迂腐守旧的麒英常常斗气，后来却发生了微妙的感情。
　　飞鸿甫到了佛山，热心助人之性格未改。先是遇上懦弱怕事的猪肉佬林世荣，猪肉荣与街市一干小贩常被果栏小恶霸简坚欺凌。飞鸿替众人出头，还教晓猪肉荣可以武自强。经此一役后，飞鸿开始教世荣功夫，也收了另一个徒弟牙擦苏，唯阿苏有读书天份，但学功夫又是另一回事，常闹出不少笑话。
　　戴啸天乃佛山蔡李佛门下的大弟子，但竟然亦是麒英收过的唯一一个徒弟。啸天跟妹妹小婷本乃一富裕商人之子女，多年前父亲死前托孤给麒英，麒英收啸天为徒弟，但啸天却误会麒英把亡父遗下的拳谱吞占，毅然带着妹子另奔前程，过着清苦的流浪生活。
　　时佛山有一米商之独子梁宽闻得飞鸿竟然能以一敌十救出猪肉荣，刚对功夫产生兴趣的他竟然跑去挑战飞鸿！飞鸿胸襟广阔，真性情兼毫不记仇，而梁宽眼见飞鸿对一班徒弟俨如对兄弟手足一样，渐被感化，最后更化敌为友，跟飞鸿学起武功来。
　　飞鸿被一少女桂兰打荷包，捉住之更要送之往官府，后来知道桂兰乃孤儿，偷钱只是望为一直照顾自己、跟自己情同姊妹的妓女玉如赎身，飞鸿因而放过桂兰一马。而玉如其实是啸天的红颜知己，啸天也希望筹钱替玉如赎身◇来飞鸿知道桂兰一直希望寻回亲生父母，愿意帮手。飞鸿终于帮桂兰找到亲生父母，竟是佛山首富莫天龙！莫天龙表面是个殷实商人，白手兴家，在佛山南海一带算是富甲一方，平日行善积德，唯暗地里走私犯毒无恶不作。
　　时有外国人挑战佛山各大门派，天龙组成一武术队迎战，派啸天出战，可是啸天竟然败阵！外国人希望飞鸿可以参赛，初时飞鸿拒绝，因为不肯当天龙走狗，天龙设法迫飞鸿屈服◇来飞鸿无意发现原来天龙跟外国人勾结，欲将干隆王遗失的玉玺偷运出国，飞鸿认为有辱国体，为了阻止此事发生，也为了接近天龙查得更多资料，毅然答应代表天龙武馆出赛！
　　麒英及所有人误会飞鸿选了歧途，麒英于是亲自踏上擂台挑战飞鸿，宁可亲手将儿子打死，也不想让飞鸿继续错下去！麒英却不知原来飞鸿一方面做卧底，另一方面希望阻止国宝被运出国◇来计划却被天龙悉破，天龙更捉去小婷要胁飞鸿跟父亲作生死斗！同一时间，玉玺正要被运送出国，飞鸿一方面吩咐宽去阻止国宝被运走，自己则希望可以在众人面前揭穿天龙的阴谋……