本片改编自推理小说家知念实希人的同名小说，背景设定在被铁栅栏封闭的原精神科医院，讲述在监狱里发生了监禁64名身份不明的住院患者和职员的事件，被牵连的速水(坂口饰)在医院内接连遇到不可思议的事情，并试图逃出的故事。。

共时性：久未谋面的高中同学荣子（黒木メイサ 饰）和朱美（藤井美菜 饰）意外见面，此外她们还发现彼此许多的共同点，这莫非就是传说的共时性？当然“偶然的一致”并不止这些。 　　被贴了：某银行小主管椎名毅（成宫宽贵 饰）自视甚高，这天他发现被人贴了撕不下去的标签。为了改变负面的评价，他尝试全力迎合周围人的想法。 　　弃物狂：为了出人头地，女主播栞（深田恭子 饰）通过抛弃身边的东西换取事业的成功。他执迷于此，却连重要的人也情愿抛弃。 　　车里的变故：故事发生在昭和时期，警察模样的男人（杉本哲太 饰）押解着黑社会小混混（古川雄辉 饰）坐在一列奔驰列车的空荡车厢中。这时，一名衣冠楚楚的男子（北村一辉 饰）走进车厢，与他们展开了罗生门般的推理。

《寺岛》：刚刚拿到第一个连载的漫画家山崎（峯田和伸 饰），因为助手突然走掉而疲于奔命。某个下雨的日子，自称寺岛的女子（吉冈里帆 饰）前来担任助手职务。作为创作素材，寺岛向漫画家讲述了一个可怕的故事。 　　《Freestyle妈妈》：人过中年的主妇细川房子（中山美穗 饰）在生活、职场中充满不快，某晚下班时一个奇怪男子推荐给她一支神秘口红。突然口红后，她就会以说唱的方式把心中不满一吐为快。 　　《命运探测器》：完全不相信命运和缘分的和泉凉平（岩田刚典 饰）至今单身，某天他捡到一块奇怪的手表，谁知这竟是一个命运探测器。此后，探测器一次次将他带到美丽女孩北泽由纪（石桥杏奈 饰）的身边。 　　《夜之声》：大型IT公司总裁我堀英一（藤原龙也 饰）人前风光，私下里则时长办成流浪汉减压。某晚，他救下了被坏人追逐的少女百合（饭丰万理江 饰）。百合从此暂住流浪汉家中，流浪汉介绍她到...

《梦男》女大学生绿翠（中条彩未 饰）每晚都在噩梦中惊醒，之后她将梦中见到的男人画了下来放在推特中，谁知引起极大反响。很多人都宣称梦到了“梦男”，世界很快陷入末日的混乱之中。 　　《少了一把》家庭主妇风见绫子（永作博美 饰）拥有完美的生活，为了守护重要的一切她不惜一切代价。近 一段时间丈夫和儿女对她极其冷淡，而家里的菜刀突然少了一把，这让绫子没来由地担心起来。 　　《变色龙演员》首次担任主演的青年演员工藤圭太（菅田将晖 饰）亚历山大，在经纪人的帮助下，他决定注射一种类似变色龙的液体，这能让他随心所欲融入各种角色。他有一个必须超越的目标。 　　《妻子的记忆》在女儿的婚礼上，成田阳一郎（远藤宪一 饰）讲述了一件离奇的事。在妻子葬礼的第二天，他突然看见妻子的身影在房间内出现。接下来的三年里，他与亡妻的残像相守度日，同时也发现了妻子不为人知的点点滴滴。

　　短短半年时间，濑户内海的小岛便漂来了6具无名男尸，这一系列神秘事件引发人们的广泛猜测，小岛更被冠以“死尸岛”这一可怕名字。英俊帅气且拥有天才头脑的科学家兼私家侦探御手洗洁（玉木宏 饰）从编辑小川美雪（广濑爱丽丝 饰）口中听到了死尸岛的传说，由此勾起了他无限的好奇心，当即启程飞赴濑户内海。
　　经过一番调查，御手洗很快判明6具尸体全部来自广岛县的福山市。当然无名尸体并未就此停止出现，不久又有一名外籍女子暴死的尸体被人发现，此外在某瀑布另有男女遭人拘禁。几宗案件有着千丝万缕的联系，御手洗甚至追溯至战国和江户时代之交所发生的重大事件。错综复杂的线索所裹挟的真相逐渐浮出水面……

　　风和日丽的一天，铃木财团巨资营建的铃木塔举行了盛大的开幕典礼。柯南（高山南 配音）和好朋友们自然受邀参观。谁知一名游客突然被远处建筑发射来的子弹狙击身亡，柯南锁定凶手果断展开追击，然而对方胆大非常，公然炸毁拦截他的警车，在重重包围中脱身而去。在此之后，FBI和日本警方组成联合调查总部，经朱蒂•斯泰琳（一城美由希 配音）介绍得知，嫌疑人很可能是原美国海豹突击队狙击手蒂莫西·亨特。战功显赫的亨特曾经获得过银星勋章，但是后来被战友指控违反交战原则，射杀了手无寸铁的平民，此后他更在战场上遭遇影响毕生的创痛，人生也彻底跌入低谷。此番他以神秘狙击手的出现，显然是想想那些毁灭了他的人生的人们复仇。
　　狙击事件接连而起，全东京陷入莫大的恐慌之中……

　　以黑长发女性为目标的连续杀人事件解决数月后，在同一事件现场又发现了新的身份不明的尸体。过去受过创伤的刑警·加贺谷学（千叶雄大）为了探究真相，前往自己曾经逮捕过的连续杀人狂·浦野善治（成田凌）那里。“是你杀的吗?” 面对加贺谷的询问，狱中的浦野透露了自己尊为老师的“M”这个神秘人物的存在。不久，加贺谷得知恋人松田美乃里（白石麻衣）被神秘男子盯上后做出了痛苦的选择，于是决定委托浦野协助调查……

《惊喜》勤恳的派遣员工藤村优希（多部未华子 饰）渴望像同事那样得到来自恋人的惊喜庆祝，于是男友和健斗（马场彻 饰）和周围的人为她送上一波又一波超乎寻常的惊喜；《奔跑的相扑弟子》上班族信田（仲村亨 饰）和后辈龟井（音尾琢真 饰）喝酒时惹到了旁边的相扑弟子，随后他们被对方追着满街跑；《未来小偷》腰缠万贯的学者大叶国正（吉田钢太郎 饰）正走向死亡，他利用人格交换机和对周遭一切都不满意的青年白井直辉（神木隆之介 饰）交换了身体，两人各自去追寻认为最有价值的东西；《冷》家庭主妇志仓赖子（若村麻由美 饰）不慎被关在打工超市的冷库中，当她获救后却发现自己越来越怕冷；《FANAMO》近未来的人们通过身体改造，可以将粪尿变成一种被称为“FANAMO”的黑色圆柱体，对该技术持抵触情绪的温子（户田惠梨香 饰）不得不和已经接受改造的恋人拓也（平山浩行 饰）面临重大的抉择。

《面具》（原作：永井豪） 　　小学生未来（铃木梨央 饰）从寺院主持那里听说了一个面孔掉落后人便离奇消失的可怕传说。当晚，同学小秋打来电话，声称自己的面孔正在脱落，即将消失。不久，未来也…… 　　《地缚者》（原作：伊藤润二） 　　日本各地被称为“地缚者”的奇怪之人相继增加，心灵协会的浅野范子（前田敦子 饰）认为这些都属于心理疾病，谁知地缚者的情况竟朝着反常的情况发展； 　　《橡胶男》（原作：尾田荣一郎）黑社会鬼头（阿部宽 饰）中弹住院，不仅身体恢复无望，还遭到组织的抛弃。气愤之际他吃了一颗恶魔果实，身体竟由此变成了橡胶体质，之后更遇到了《海贼王》的主角路飞； 　　《昆虫之家》（原作：楳图一雄） 　　衣冠楚楚的男子纮一（板尾创路 饰）曾和美丽温柔的妻子留衣子（长谷川京子 饰）相亲相爱，可是不知从何时开始两人却渐行渐远。直到某天，留衣子变成了蜘蛛； 　　《相信着自己的男人》（原作：石...

位于东京的东都线地铁开通当日，一起针对东京都知事朝仓优一郎的炸弹袭击事件爆发，导致东都线列车损毁。经过一番推理，柯南（高山みなみ配音）等人认定这与8年前朝仓主持负责的北之泽水坝的修建有关。当年为了修建大坝，朝仓动员北之泽村的人民搬入新村，可是仍有许多人反抗到最后阶段。为了探明真相，柯南、灰原（林原めぐみ配音）、少年侦探团以及毛利小五郎（小山力也配音）等人开赴白雪皑皑的北之泽。在这片纯净的雪国，少年们尽情玩耍，与此同时他们也遇到了几名原北之泽村的村民，山尾溪介、远野瑞希、立原冬美等人。他们是从小一起长大的好朋友，而彼此之间似乎又有着某种芥蒂和秘密。真相究竟如何……本片为《名侦探柯南》第15部剧场版。