经过上百万年的进化，熊猫一族经历了无数艰难险阻，走到今天。虽然濒临灭绝的熊猫接受了人类的细心呵护，但是一场史无前例的灾难即将席卷它们的栖息地，狂风暴雨会引发洪水，毁灭熊猫一族。担心子孙的命运，祖先们向熊猫菩萨（赵忠祥 配音）请教，菩萨预言将有一只继承了祖先们智慧的超级熊猫降生，拯救本民族的命运。与此同时，森林中名叫潘迪（何炅 配音）的小熊猫诞生，此时此刻他还并不知晓自己所肩负的使命。 调皮顽劣的潘迪惹出不少的麻烦，也经历了诸多的考验，同时结交了许多的好朋友。在祖先之一（李扬 配音）的冥冥指引下，潘迪逐渐担当起本族未来的重任……
本田透是一个天真、善良、迷糊的高中女生，从小与妈妈相依为命。但一场车祸夺去了妈妈的生命，让小透成了一个孤儿，她带着全部家当搬到山林里，过起了林间独居的帐篷生活。在命运的安排下，小透无意中走进了一个古老大宅，邂逅了奇怪的男子草摩紫吴。原来他是草摩由希的表哥，而由希又是学校里一致公认的王子，这间大宅正是由希的住所。当天晚上林间土石塌方，小透所住的帐篷被土石掩埋，幸好由希和紫吴将她及时救出，让她暂时住进他们的大宅里。 草摩家族几百年的秘密被小透发现，由希、紫吴等人只要被异性拥抱，就会立刻变身为十二生肖中的对应生肖。另一个神秘的少年阿夹，不仅变身为猫而且还隐藏着这个家族中更大的秘密。草摩家族的当家人发令，必须消除知道真相的小透的记忆。而小透一句“就算我的记忆消除了，请你还是继续和我做朋友”感动了由希、阿夹等人，她更像一缕温暖的阳光，照亮了阴雾重重的草摩家族。
某日，小新（矢岛晶子 配音）在河堤上捡到了一瓶神秘的液体，把它带回家放在了冰箱里。哪知道美伢（楢桥美纪 配音）和广志（藤原启治 配音）在无意之中将其喝下，隔天竟然变异成为了动物。 之后，一个神秘的环保组织SKBE掳走了小新一家人，而为首的，竟然是双叶里的里长四膳守（山寺宏一 配音）。原来，四膳首是一位激进的环保主义着，妄图通过一种神秘的药物将破坏环境的人类全部都变成动物，而小新捡到的神秘液体就是还尚处于测试阶段的药物，四膳守准备将美伢和广志当做实验对象进行研究。在神秘女子维多利亚（后藤邑子 配音）的帮助下，小新一行人成功出逃，他们和春日部防卫队一起，决心破解四膳守的阴谋。
在散发着青春朝气的圣条学院，高一新生井上心叶（入野自由 配音）偶然结识了高二前辈天野远子（花泽香菜 配音），由此加入了天野担任部长只有她一名成员的文学部。天野是个奇怪的女孩，文学对她来说就是味道不同的食物，她拒绝着写满文字的纸片，动人优美的笔触甘之若饴，糟糕的文字则如鲠在喉却不忍弃之。除此之外，他们还面对全校开展代写情书的业务，只不过应者寥寥。这一天，信箱里收到久违的信件，可是纸上却只有一幅涂鸦。经过查询，那个涂鸦竟然来自诗人兼童话作家宫崎贤治。看似是一桩恶作剧，但却勾起了心叶对天才文学少女井上美羽和那名自杀女孩的痛苦记忆…… 本片根据野村美月的轻小说改编。
第二季讲述的剧情是人类曾一度因被巨人捕食而崩溃。幸存下来的人们。
